注册日本公司需要相关手续，同理，日本公司不要了也不能置之不理，需要办理注销手续，如果不注销每年还是要进行年审和报税。日本公司注销并不复杂，理清相关手续步骤即可。首先选择日本公司注销的方式：
1、注销
公司注销是指当一个公司宣告破产时，被其它的公司进行收购、规定的营业期限届满不续、或者公司内部解散等情形时，公司需要到登记机关申请注销，终止公司法人资格的一个过程。
公司注销可以是主动行为比如说执照期满不续，也可以是被动行为，例如公司被撤销或被吊销之后都应该按照法律规定进行清算并进行注销。
2、吊销
吊销是指企业违反了工商行政管理的相关法规，被工商部门采取强制手段剥夺其经营资格的一种行政处罚。这是行政机关对企业实施的较为严厉的行政处罚。吊销属于一种行政处罚，不会以企业申请为前提，主要是由登记机关直接依职权、主动而为。吊销后公司经营资格也将会丧失，从某一定程度上来讲，吊销也是公司退出市场的一种方式，但和注销相比，吊销不是一种合法的退出市场的方式，而是因为违法行为导致的一种行政处罚。
3、撤销
撤销是指工商部门或者是其上级行政机关根据利害关系人的请求或者依据职权，作出的撤销行政行为的一种决定。
通俗上来讲，撤销就是对已经完成的登记行为的否定，或者说是一种纠错的行为，错误的登记丧失法律效力。前提是自始不符合登记的相关条件，但是通过非法情形取得了公司的登记，比如登记人员滥用职权、违反法定的程序，或者申请人提交虚假材料、隐瞒了一些重要的事实等等，登记机关通过撤销来纠正这个登记错误。
常见的三种撤销包括了：
（1）撤销公司设立登记，后果是公司设立登记自始无效；
（2）撤销公司变更登记，后果是公司恢复到该次变更登记之前的登记状态；
（3）撤销公司注销登记，后果是公司恢复到注销之前的登记状态。
我们常说的日本公司注销说的就是第一种方式。日本分支机构和日本分公司注销的手续不一样，我们一起来看看。
日本分支机构注销手续
在日本注销分支机构，要办理分支机构的注销登记和所有代表人的卸任手续。如果不办理所有驻日代表人的卸任手续，就不能注销日本分支机构的注册证照。这是因为如果代表人的注册证照仍然存在，就有可能继续经营业务。相反，如果驻日的所有代表人都成功办理卸任手续，在日本的分支机构也同被注销。所有在日代表人的卸任手续的一般流程如下：
1、外国企业决定注销分支机构，撤销驻日的所有代表人；
2、通过个别通知和政府公报催告债权人对注销分支机构提出异议；
3、向税务机关申报备案纳税管理人；
4、关闭分支机构(上述2的通知和公告发布1个月以后）；
5、制作注销分支机构，撤销驻日所有代表人相关的宣誓陈述书；
6、由驻日大使馆领事等认证宣誓陈述书；
7、向法务局申请撤销驻日所有代表人；
8、领取注销事项证明(申请注销后约2周)；
9、向税务机关等申报分支机构的注销；
在对所有驻日代表人办理卸任手续后，注册证照会被注销，但不会记录分支机构的注销日期。通常，只需在宣誓陈述书中记录分支机构的注销日期。如需在注册证照上记录分支机构的注销日期，必须办理（1）分支机构的注销手续，（2）所有驻日代表人的卸任流程两种手续。另外，如管辖驻日代表人的住址所在地和分支机构所在地的法务局不同，则有可能要向管辖代表人住址所在地的法务局申请同营业所地址变更相同的手续。
日本子公司注销手续
解散、清算子公司(日本法人)手续的一般流程(股份公司，联营公司)：
1、股东大会等通过决议解散子公司（日本法人）并委任清算人；
2、向法务局申请注册子公司（日本法人）的解散和清算人的委任；
3、向税务机关申报子公司(日本法人)的解散和清算人的委；
4、通过个别通知和政府公报催告债权人对子公司(日本法人)的清算主张债权；
5、制定解散时的资产负债表以及资产目录；
6、股东大会决议通过上述资产负债表以及资产目录（联营公司的情况下，需通知各雇员）；
7、确定并分配剩余资产；
8、股东大会等决议通过清算终结 (上述4的通知和公告发布2个月以后）；
9、向法务局申请注册子公司（日本法人）的清算终结；
10、领取注销事项证明（申请注销后约2周）；
11、向税务机关等申报子公司（日本法人）的清算终结。
日本公司注销需要提供的资料
1、公司法定代表人签署的《公司注销登记申请书》以及公司清算组织负责人签署的注销登记申请书；
2、《企业法人营业执照》正、副本、税务部门出具的完税证明；
3、股东会或者有关机关确认的清算报告、法院破产裁定、行政机关责令关闭的文件或公司依照《公司法》作出的决议或者决定；
4、银行出具的帐户注销证明以及法律、行政法规规定应当提交的其他文件。
需要注意的是，即使日本公司以及申请破产了，依然需要走公司注销手续，因为虽不需要办理注销手续，工商营业执照不再年检将会自动注销公司执照，但是这样的做法在3年内不再有资格成为公司法人，3年后才可以恢复正常，所以对于这点还是建议大家办理正规的注销手续。
综上所述，注销日本公司虽然不难，但是需要的资料文件并不少，当然如果自己一个人相关部门申请那就是一头雾水的，专业事情还是要请专业的人来办理好，既能省事又能避免各种潜在的风险。
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