日本公司的年审开始于公司注册满一年之后。对于不少企业家，创立的日本公司其实是作为空壳公司使用。因为没有账户，也没有实地经营，这样的公司在年审报税的时候，前三年在年审的时候提供注册证书做零申报就可以了。
日本企业主要需要缴纳三种税种：法人税（利得税）、消费税（增值税）、地方税（事业税和住民税） 以及不需要做独立核算的分公司。
法人税的缴纳金额跟公司的注册资金和营业额有关。即根据该日本公司的注册资本，采取不同的纳税比例：注册资本在5000万日元一下，法人税税率为18%-24%；注册资本为5000万日元以上，则采用24%-35%的税率。
消费税即增值税，根据商品的价格，按照5%的比例来征收。而在公司注册成立的前两年，是可以根据条件来申请减免消费税的。
地方税分为事业税和住民税。地方税是根据企业的利得税，按照1.2%-4%的比例来缴纳。
分公司，需要不做独立核算，法人税按照公司的总公司资本金为基础，税务可以拿回国内退税。
日本的税务申报时间，在各会计年度结束后的2个月之内，需要根据股东大会的决算报告计算出需缴纳的税额，然后公司提交相关税种的税务申报书并缴纳税款。
日本公司年审流程：1. 签署委托协议→2. 支付费用→3. 递交年审申请，政府审批→4. 领取文件，年审完成。
年审完成后就会得到全新的商业登记证和年审证书。
注意：日本公司年审后，还要携带相关年审文件至银行账户进行账户年审，所以客户需妥善保管好年审文件，以备账户年审之用。
日本公司管理费用：
1. 地址使用费
2. 向税务局提请零申报（包括：年初申报、固定资产申报、年终决算）。
3. 年金事务所、劳动基准局等日本行政机关的对应、信件收发。
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